在医学诊断领域，国内大部分公司只能在细胞层级进行分析，但像亲子鉴定，疑难杂症的致病基因分析，就需要首先得到人的基因序列才行。Illumina公司首先开发出了基因测序设备填补了业界的空白，但是采购illumina的设备成本。试剂成本非常的高，所以国内的很多人开始了基因测序仪的开发。基因测序仪包括化学反应控制系统，光学成像系统，图像分析系统。 基因测序仪的基本原理就是不同种类的碱基会跟不同的荧光物质结合，从而在显微镜下发出不同颜色的光，可以通过测序阶段FlowCell上簇的图像，来推断出当前对应的碱基是AGTC的哪一个。光学成像系统的主要任务就是采集得到化学反应过程中FlowCell上簇的图像，为以后的图像分析打下基础。 因为芯片本身采用了光刻打孔技术，所以簇都是分布一个一个打好的孔中，最终的图像看到就是一个一个的亮点分布在整个FlowCell之上。通过提取每一个亮点的图像特征，积累到了海量的基因图像数据，然后通过机器学习算法，分析得到基因的成像规律。

1.传统的细胞病理诊断方式为，首先从病人身上采集样本细胞，然后对采集到的样本细胞进行预处理，经过制片染色以后，然后由细胞病理医生在显微镜下观察细胞形态和染色体特征，给出诊断报告。 2. 新的细胞病理云诊断系统流程的前半部分(取样，染色，制片)和之前的系统并无不同，所不同的是将扫描获取到的数据传到云服务器上，然后将采集到的数据推送给职业的细胞病理医生进行诊断，最后给出报告。 新的系统打破了区域隔离，将数据统一传送至云服务器。首先，虽然制片，染色，扫描等步骤依然是在不同的医院进行的，会有差异，但是扫描出来的数据是统一上传到云服务器上的，质控人员可以看到扫描出来的数据信息，进而对制片，染色，扫描过程中出现的问题进行分析并指导当地的操作人员进行修正。再者，在后续的步骤中中，参与诊断的医生由公司统一安排，必须经过系统的培训考核，才能参与诊断并且给出报告，诊断的准确性得到了很好的提高。 3.系统设计思路 按照实际中的设备分布和需求，系统自然的划分成以下几个部分：扫描模块，文件上传模块，人工诊断模块，以及中心调度模块。样本在经过预处理之后，首先自动扫描模块采集到样本图像信息，然后将得到的样本数据传递给文件上传模块，文件上传完成后，最后由最后人工诊断模块做最终的诊断，中心调度模块位于云上，负责对整个工作流进行调度管理。