基于R语言开发了Rcirc包用于环状RNA可视化分析，该作品以“Rcirc: An R Package for circRNA Analyses and Visualization”论文在线发表，项目github地址为https://github.com/PSSUN/Rcirc

在下游分析中我们发现官方 Iso-Seq 数据分析软件存在许多问题。同时现阶 段 Iso-Seq 转录组分析软件十分匮乏。为此我们开发了 Iso-Seq-Tools 分析工具包 完善了 Iso-Seq 转录组数据加工流程。同时添加对 Iso-Seq 注释文件的基本信息统 计和转录调控事件鉴定的功能。Iso-Seq-Tools 是一款整合的 Iso-Seq 转录组分析 工具，主要功能包括:完善 Iso-Seq 数据全长非嵌合序列 (FLNC) 的矫正过程、 对转录组基本信息、多顺反子转录本、无义介导的 mRNA 降解机制 (NMD) 候 选转录本、可变聚腺苷酸位点进行统计和鉴定。本软件可为研究人员分析 Iso-Seq 转录组提供便利。Iso-Seq-Tools 使用 Python2 语言编写，在 CentOs7.5 操作系统 上成功测试运行。该作品已申请软件著作权，且“Landscape, complexity and regulation of a filamentous fungal transcriptome”已发表。

多功能基因组分析软件（GOAT）是一款整合的基因组分析工具包，其功能多样，涵盖了基因组分析的多个方面。主要包括：对基因组序列文件（FASTA）的操作和统计、基因组注释文件（GTF/GFF3）的提取和格式化、基因组比对二进制文件（BAM）的分箱和特定区域的覆盖度计算、多个物种的比较基因组学分析和可视化、基因组共线性分析、PAML受选择压力分析、6mA甲基化分析等功能，其中部分功能支持多线程运行。该软件包可以为功能基因组研究人员提供便利，为后续实验验证提供指导。多功能基因组分析软件（GOAT）利用Python（version. 3.5）语言编写，并在Ubuntu（V16.04）操作系统上试运行通过。多功能基因组分析软件（GOAT）可以免费供个人非商业用途学习或科研使用。该作品已申请软件著作权。