BRENDA (The Comprehensive Enzyme Information Syste

我要开发同款
Shutong_Zheng2023年06月16日
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开发技术c++
所属分类算法、NP问题、教育

作品详情

项目分为以下三个主要功能模块:
词法和语法分析器模块:此模块负责解析和理解反应描述语言。这是用户与系统之间交互的主要接口,可以理解并转换用户输入的数据。
数据提取算法模块:这是该系统的核心模块,其功能是寻找从特定反应物到特定产品的所有可能反应路径。这个模块可以实现顺序提取或并行提取。
输出模块:此模块负责将找到的反应集按照规定的格式呈现给用户。对于用户来说,这个项目可以帮助他们找到所有可能的反应路径,这些路径以特定的反应物开始,并以特定的产品结束。

作为该项目的唯一开发者,我负责以下任务:
设计和开发上述所有模块:编写这些模块的代码,并确保它们可以正确地执行预期的功能。
选择和使用技术栈:根据项目需求,选择c++作为主要编程语言,并可能使用并行编程技术以充分利用多核处理器。
编写项目文档:这包括用户手册,以帮助用户理解如何使用我的系统,以及实现文档,解释你的代码是如何工作的。

遇到的难点以及解决方法:
实现高效的数据提取算法:因为该问题是NP完全问题,所以实现一个有效的算法可能会很困难。我通过研究 DFS , BFS 和 IDDFS ,并设计出高效的搜索策略,来解决这个问题。
并行编程的挑战:在并行化我的代码时,会遇到线程安全性和线程之间的竞争条件等问题。我使用互斥量和条件变量来实现。
解析和处理用户输入:理解和正确处理用户输入的格式可能是一个挑战。你可能会通过对输入进行严格的验证,以及编写详细的用户手册来解决这个问题。
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