仓库管理模块（WMS）
仓库管理模块实现仓库管理层的功能，通过对物料托盘和仓库货位进行全面的信息化管理和对调度模块的信息进行收集归类、整理和分析，实现仓库物料的自动化存储和出入库，及时准确地反映仓库物料的收发情况、储备状况，使管理人员能够随时掌握物料的消耗情况和趋势，可有效避免物料在生产过程中出现积压或短缺，有效控制物料的存储成本，为企业生产决策提供准确、快捷的材料和数据。
仓库管理模块还支持多种存取策略以满足不同出入库需求；可通过接口中间件提供的多种接口方式与不同的上层管理系统、底层执行设备系统进行无缝对接和数据交互，是TIMMS系统应用逻辑的支持平台。
调度控制模块（WCS）
调度模块是连接物流管理层及设备执行层的枢纽。其功能是实时接收物流管理系统下达的任务指令，分解并通过作业接口层下达给具体的作业执行层，对物流过程作统一的调度，并对各个物流环节、现场关键设备及工艺点进行监视、控制。系统设计通过对象转换插件的方法，集成不同厂家、不同类型的物流设备，完成集中控制操作、状态监视、报警显示、日志记录等功能。
物流作业执行系统
物流作业执行系统是集成了各种执行设备的工业控制网或专用PLC、PC控制子系统，其功能是接受调度模块下达的指令，驱动物流设备完成相关动作，实现物料自动化输送和流转。具体设备系统包括：输送机控制系统（TECS）、堆垛机控制系统等。