该项目独立完成。
1、仪器通讯模块：上位机与下位机之间的指令交互，采集数据上传；下位机各元器件调试、调整；下位机固件升级；FPGA通讯调试；下位机功能模块的通讯指令封装下发、接收处理；下位机心跳报文接收、处理；下位机硬件故障信息的接收、处理等。
2、数据采集模块：上位机采集FPGA接收处理后的细胞数据，做进一步解析处理到相应的通道下供上层调用展示数据信息。采集过程中通过调节各个通道间的增益来调整数据，利用阈值来截取数据。
3、数据分析模块：
1.提供散点图、直方图、伪彩色图、统计图等的添加功能，重新绘图、图形的重新排列等。
2.提供竖线门、区间门、双曲间门、椭圆门、矩形门、角度椭圆门、十字门、铰链门、多边形门、自动圈门、逻辑门等都多种圈门方式。
3.提供坐标单边平移、放大坐标轴、缩小坐标轴、补偿调节箭头、补偿调节矩阵窗口等工具。
4.提供撤销、恢复功能。
5.流式图功能：切换显示群体目标、切换横轴通道、切换纵轴通道、调节坐标参数（最小值、最大值、线性、对数、线对系数、线对系数是否使用）、配置图形是否显示在报告中、配置图形是否输出到LIS系统、配置以样本的显示粒子数、流式图类型间的随意切换、粘贴复制的门到流式图中、删除图形、图形的重复创建、图形样式设置、复制图形到剪切板、保存图片到本地，流式图在面板中可以拖拽移动、流式图大小比例缩放、在流式图形中画门等。
直方图特有功能：透明度显示设置、平滑度显示设置。
6.门功能：编辑门名称、选择显示的颜色、是否要显示颜色、显示颜色优先级设置、复制门以便粘贴到其他图形中、删除门、门在流式图中拖拽移动、门大小比例缩放、门标签在流式图中拖拽移动等。
7.统计图功能：表达式添加、编辑、删除；统计图显示结构（表格、树）、绝对计数设置（体积法、微球法）、统计显示通道设置、统计通道数据类型设置（Mean、Median、SD、CV、Min、Max、GMean、HPCV、rCV、rSD）、统计类型设置（高度、面积）、统计群体显示设置、统计图删除、统计图最大化到面板区域等。
8.工作簿管理：实验下样本信息编辑、上传LIS系统、从LIS系统下载信息、工作簿样式高级配置（自定义显示列头内容、顺序、是否显示、扩展字段）等。
9.报告模块：支持报告的自定义编辑，存储模板。
4、实验管理模块：新建普通样本实验、新建采集自动补偿实验、新建分析自动补偿实验、保存实验、打开实验（按登录用户、实验类型、日期）搜索，支持登录用户可以搜索自己用户的实验、删除实验、导出实验数据、导入实验数据、关闭当前打开的实验等。
5、样本管理模块：新建空白样本、新建精子检测样本、从模板新建样本、从转盘拖拽新建样本、从孔板拖拽新建样本、复制样本、批量新建样本、删除样本、存储模板、应用模板、导出统计结果、导出FCS数据、样本检索查询、样本采集过程中支持修改其他样本的名称、样本审核、取消审核、病例档案查询、导出PDF报告、打印报告、样本个数按条件检索、导入FCS文件、导出FCS文件、支持多项目（一个样本下可以做多个项目，合并成一个报告输出）等。
6、质控：质控分仪器质控、项目质控两种。质控模板参数设置、质控靶值库管理、质控批号管理、质控样本采集、质控样本回溯、质控报告管理（按批号、日期检索、每个质控样本可以设置各群体参数下的指标、质控日期、状态显示、是否当日最新标识、质控报告显示）、导出质控PDF报告、质控样本数据LJ图显示等。
7、系统配置模块：
1.激光器模块配置：支持每种配置下自定义所需通道，默认提供所有配置，根据用户需求自行勾选是否启用。
2.上样模式配置：支持单管、40孔转盘、96浅孔板、96深孔板四种模式下的参数配置。
3.数据采集配置：细胞采集所需的参数配置等。
4.软件系统配置：多语言配置、打印机配置、样本审核授权配置、实验数据路径配置、数据导出路径配置、孔板样本矩阵申请规则配置、统计数据小数位配置、样本命名规则配置、门命名喜好配置、LIS系统参数配置、工作簿参数配置、仪器参数配置、日志路径配置、账户管理（支持权限管理）等。
8、通讯调试模块：
1.运动调试：电磁阀、注射泵、鞘液泵、空气泵、进样针、混匀点击、滑台、转盘调试。
2.参数调整：进样针、转盘、滑台、混匀高度、实验参数等调整。
3.整机调试：整机老化实验。
4.固件升级：液路控制板、上样器控制板程序的升级。
5.USB调试：FPGA程序的调试。
6.WDM模块：各WDM温控参数配置、状态显示等。
7.激光器模块：各激光器控制调试、功率配置、读取等。
9、其他模块：
1.软件介绍：各版本记录更新。
2.仪器报警日志：查看登录用户及子用户的报警日志、支持按用户、时间进行搜索显示、导出到CSV文件中、支持翻页操作（首页、上一页、下一页、末页、跳转至某一页）等。
3.状态显示：仪器连接状态工作状态显示、各个控制板心跳监控、液位监控等。
4.3Q认证：样本审核授权、电子签名、审计追踪。