GATK是GenomeAnalysisToolKit的缩写,是一款从高通量测序数据中分析变异信息的软件,是目前最主流的snpcalling软件之一。GATK设计之初是用于分析人类的全外显子和全基因组数据,随着不断发展,现在也可以用于其它的物种,还支持CNV和SV变异信息的检测。
项目同时提供了完整的分析流程GATKBestPractices。
GATK是GenomeAnalysisToolKit的缩写,是一款从高通量测序数据中分析变异信息的软件,是目前最主流的snpcalling软件之一。GATK设计之初是用于分析人类的全外显子和全基因组数据,随着不断发展,现在也可以用于其它的物种,还支持CNV和SV变异信息的检测。
项目同时提供了完整的分析流程GATKBestPractices。
评论