Fqutils FASTQ格式命令行工具开源项目

我要开发同款
匿名用户2012年09月20日
62阅读
开发技术C/C++
所属分类企业应用、教学科研相关
授权协议zLib

作品详情

Fqutils提供了一套基本的生物信息学序列数据FASTQ格式与命令行工具。格雷格·汉农的优良Fastx工具包套件的补充。的是,它正确地处理FASTQ格式发布的标准,该标准明确允许多行序列和质量得分记录信息每所描述的特征之一,Fqutils。fqutils旨在作为早期部分postsequencing管道和质量评估进程的一部分,是有用的。

FqutilsprovidesabasicsetofbioinformaticscommandlinetoolsforworkingwithsequencedatainFASTQformat.ItcomplementsGregHannon'sfineFastxToolkitsuite.OnecharacteristicofFqutilsisthatitcorrectlyhandlesthefullFASTQformatasdescribedbythepublishedstandard,whichspecificallyallowsmultilinesequenceandqualityscoreinformationperrecord.Fqutilsisintendedtobeusefulaspartoftheearlyportionsofpostsequencingpipelinesandqualityassessmentprocesses.

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